Цель создания ГЦМО ЭМС — обеспечение координации организаций различных отраслей и профессиональная деятельность в области электромагнитной совместимости (ЭМС) по основным направлениям. Специалисты государственного центра на протяжении многих лет осуществляли экспертизу и анализ стандартов, поверку средств измерений, аттестацию испытательного оборудования в области электромагнитной совместимости, а так же занимались разработками средств измерений и испытательного оборудования.